A Direcção Pedagógica (DP) é o órgão da Vice-Reitoria Académica responsável pela planificação e gestão dos processos pedagógicos na Universidade. A ela cabe, em especial, dirigir, promover, apoiar e supervisionar a realização de actividades de natureza organizativa, normativa e de pesquisa pedagógica, destinadas a melhorar a qualidade do ensino-aprendizagem e a eficácia das decisões respeitantes aos processos de formação dentro da Universidade Eduardo Mondlane.